可以。
在建工程抵押和房屋预售之间没有必然的限制关系，应该是并行不悖的。
因为房屋建设符合《房地产管理法》44条的规定和《商品房预售管理办法》规定的条件，所以开发单位可以办理预售许可证。
当房屋建设到一定程度，开发商为了解决后续建造资金，经和银行协商一致，以合法取得的土地使用权连同在建工程建成的资产设定抵押权时，只要主债权合同有效，并签订有在建工程抵押合同，就可以申请在建工程抵押。
一般是经抵押权人同意，会同抵押人共同申请在建工程抵押权变更登记，将需要出售的抵押物注销抵押权后，即可进行预售，也不影响变更后的在建工程抵押权的存在。
操作时，先办理在建工程抵押权变更登记，减少可能出售的抵押物或增加别的在建工程抵押物，注销相应的抵押权内容，然后，将不在在建工程抵押权内的预售房屋进行预售。
１、在建工程抵押贷款的用途为在建工程继续建造所需资金。《物权法》出台前信贷客户不得用在建工程为他人的债务提供担保，也不能为自己其它用途的债务进行担保，而只能为取得在建工程继续建造资金的贷款担保。《物权法》实施后在建工程抵押可以为其他债权种类设定抵押，对在建工程抵押担保的种类没有限定。
２、在建工程占用范围内的土地，已经交纳全部土地出让金，并取得国有土地使用权证。
３、在建工程抵押必须已经取得土地使用权证、建设用地规划许可证和建设工程规划许可证。《城市房地产抵押管理办法》明确规定，在建工程抵押合同应载明土地使用权证、建设用地规划许可证和建设工程规划许可证三证的编号，同时，正在建造的在建工程抵押，还必须取得建设工程施工许可证。
４、投入工程的自有资金必须达到工程建设总投资的２５％以上，并已经确定工程施工进度和工程竣工交付日期。
１、在建工程合法性风险。
根据相关法律法规，抵押人必须已经取得在建工程占用土地的国有土地使用权，同时还必须已经获得有关部门关于同意其进行建造的建设用地规划许可证及其他证件。根据建设部《城市房地产抵押登记办法》和《最高人民法院关于适用＜ 中华人民共和国担保法＞若干问题的解释》，在建工程抵押贷款的借款人只能为抵押人，贷款人只能是金融机构（一般是银行），贷款用途只能用于在建工程继续建筑资金。
２、价值确定风险。
在建工程抵押权范围仅限于设定抵押时已经建成并登记的在建工程和该在建工程占用范围内相应比例的土地使用权，而不包括登记后在建工程上继续新增的层数和占用范围外的土地使用权。
３、合同风险。
建设部《城市房地产抵押登记办法》规定以在建工程抵押时，抵押合同还应当载明以下内容：
（１）《国有土地使用权证》、《建设用地规划许可证》和《建设工程规划许可证》三证的编号；
（２）已交纳的土地使用权出让金或需交纳的相当于土地使用权出让金的款额；
（３）已投入在建工程的工程款；
（４）施工进度及工程竣工日期；
（５）已完成的工作量和工程量。如果用一般的抵押合同，很可能导致在建工程抵押合同无效。
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