由于年代久远、房屋产权登记制度不健全，无证房与历史遗留房屋的确认难度非常大，部分地区主要采取由街道、社区或相邻住房互相印证等方式完成，并未取得有效的证据材料来证明认定结果，因此无证房与历史遗留房屋的补偿，往往也是拆迁项目中最容易被个别人钻空子，成为套取国有资金的便捷渠道。审计要取得确凿证据，找到突破口，就要将符合政策要求年代的航拍地籍图资料等作为最重要的确认依据， 并结合拆迁现场测绘图等原始资料，分析比对其相关性与一致性。
非住宅拆迁户所涉及的土地范围广，房屋数量多，地上建筑情况复杂，补偿资金量大，特别是部分国有大中型企业在拆迁时，不仅需要签订拆迁补偿协议，同时还会签订一些补充协议，审计人员更应加以谨慎区分与对待，认真分析协义签订的内容。
受当前拆迁管理机制不健全，管理制度不完善，补偿标准不明确，部分责任人管理缺位等因素的影响，拆迁过程中增加拆迁成本从而损害国家利益的行为时有发生，因此在审计过程中，一是应测评内部控制制度是否健全，内部管理机制运行是否正常，审查是否存由于制度不严、标准不明、内控缺失等问题导致部分拆迁人寻租空间较大，从而发生损害国家利益的行为。如根据拆迁台账记录，对住宅用房中分户安置无标准，随意性大，分户安置的面积为原住宅面积的几倍，同时部分还建人与被拆迁房屋人户籍住址不在同一地点，也不属继承、赠予或共有产权等情况，应予以严查。
征地拆迁安置补偿项目主要存在以下几类问题：第一类是拆迁过程中违反地方政策法规规定，多计算补偿款的问题；第二类是不按拆迁方案操作造成国有资金损失的问题；第三类是弄虚作假骗取国有资金的问题；第四类是拆迁管理制度不完善，存在责任风险的问题。审计中需要注重从以下的几个方面入手。
（一）熟悉政策，收集地方法律法规，从基础工作入手
（二）合理分组，分类整理，从审计资料源头入手
1、分组分工要合理。
2、资料分类要合理。
（三）理清思路，抓住重点，从细节推进入手
《中华人民共和国土地管理法》以下简称《土地管理法》第四十六条规定：“国家征收土地的，依照法定程序批准后，由县级以上地方人民政府予以公告并组织实施。被征收土地的所有权人、使用权人应当在公告规定期限内，持土地权属证书到当地人民政府土地行政主管部门办理征地补偿登记。”这一法律条款明确规定征地拆迁工作的实施主体，只能是被征用土地所在地的县级以上地方人民政府。该人民政府的土地行政主管部门负责具体实施。
在现实的征地拆迁工作中，严格按照这一规定实施的很少，大多数情况是，由政府成立一个临时机构，有的叫开发区，有的叫工业园，也有的叫支持什么建设项目指挥部，人员由各个部门临时抽调。政府将征拆工作全部交由此机构实施，也有的县一级政府直接将某一个建设项目的征地拆迁工作委托乡镇一级人民政府实施，土地行政主管部门不直接参与组织实施。
征用土地公告是征用土地的必经程序，征用土地公告分为两种，一是征用土地公告，二是征地补偿、安置方案公告。
国土资源部发布的《征用土地公告办法》第四条规定：“被征用土地所在地的市、县人民政府应当在收到征用土地方案批准文件之日起10个工作日内进行征用土地公告，该市、县人民政府土地行政主管部门负责具体实施。”
第五条规定：“征用土地公告应当包括下列内容：(一)征地批准机关、批准文号、批准时间和批准用途;(二)被征用土地的所有权人、位置、地类和面积;(三)征地补偿标准和农业人员安置途径;(四)办理征地补偿登记的期限、地点。”这两条所规范的是征用土地公告的时间和内容。
第七条规定：“有关市、县人民政府土地行政主管部门会同有关部门根据批准的征用上地才案：在征用土地公告之日起45日内以被征用土地的所有权人为单位，拟订征地补偿、安置方案并予以公告。”
第八条规定：征地补偿、安置方案公告应当包括下列内容：(一)本集体经济组织被征用土地的位置、地类、面积、地上附着物和青苗的种类、数量、需要安置的农业人口的数量;(二)土地补偿费的标准、数额、支付对象和支付方式;(三)安置补助费的标准、数额、支付对象和支付方式;(四)地上附着物和青苗的补偿标准和支付方式;(五)农业人员的具体安置途径;(六)其他有关征地补偿、安置的具体措施。这两条规范的是征地补偿、安置方案公告的时间和内容。
在现实的征地拆迁工作中，完全按照法律、法规、规章的要求进行公告的很少。有的小项目未进行公告，有的制作了公告未张贴，有的应公告两次而只公告了一次，有的公告内容不完整，还有的在未收到征用土地方案批准文件时即发出征用土地公告。因此，公告内容缺少批准机关、批准文号和批准时间。征地不依法进行公告，违反了法定程序，剥夺了被征地农民的知情权，并将产生严重的后果。依据《征用土地公告办法》第十四条的规定，未依法进行征用土地公告的，被征地农村集体经济组织、农村村民或者其他权利人有权依法要求公告，有权拒绝办理征地补偿登记手续。未依法进行征地补偿、安置方案公告的，被征地农村集体经济组织、农村村民或者其他权利人有权依法要求公告，有权拒绝办理征地补偿、安置手续。
《征用土地公告办法》第九条规定：“被征地农村集体经济组织、农村村民或者其他权利人对征地补偿、安置方案有不同意见的或者要求举行听证会的，应当在征地补偿、安置方案公告之日起10个工作日内向有关市、县人民政府土地行政主管部门提出。”第十条规定：“有关市、县人民政府土地行政主管部门应当研究被征地农村集体经济组织、农村村民或者其他权利人对征地补偿、安置方案的不同意见。对当事人要求听证的，应当举行听证会，确需修改征地补偿、安置方案的，应当依照有关法律法规和批准的征用土地方案进行修改。”
依照上述规定，被征用土地的农民对征用土地补偿、安置方案有不同意见，有权要求听证，并有时限要求。因此，征用土地的实施机关应当向被征地的农村集体经济组织、农村村民或者其他权利人交待听证权。可以在征用土地补偿、安置方案公告中告知听证权，也可以用其他方式告知听证权。但在现实的征地拆迁工作中，几乎都没有告知听证权，更谈不上举行听证会，实质上剥夺了被征地农民要求举行听证的民主权利。
被征收土地的所有权人、使用权人在公告规定的期限内，持土地权属证书到政府土地行政主管部门办理征地补偿登记后，政府土地行政主管部门应当对补偿登记的项目逐项进行详细的调查核实，填写房屋设施、青苗等拆迁补偿表。这项工作量大、专业性强、复杂、烦琐，也很容易出差错，要求工作人员具有较高的专业素质，耐心细致的工作作风。但在现实征拆工作中，工作人员的政治业务素质达不到要求。
调查核实工作差错较多：一是遗漏项目，几乎每一拆迁户都有补遗的问题。有的遗漏的项目还不少。二是适用补偿标准不准确，被征地的农民之间互相比较，如果标准算高了他不找你，如果算低了他就来找你。三是适用补偿标准随意性大、不公正，关系好的标准定得高一些。四是工作责任心不强，简单粗暴，不向拆迁户做耐心细致的思想工作，导致拆迁户产生抵触情绪。
《土地管理法实施条例》第二十五条规定：“征用土地的各项费用，应当自征地补偿、安置方案批准之日起3个月内全额支付。”在现实征拆工作中，有的征地补偿费不能在规定的期限内全额到位。有的拆迁项目，拆迁户将房屋拆除后，在过渡房内居住一年以上，重建地还未出来。
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