倒卖文物罪与非法经营罪都是从1979年刑法设立的投机倒把罪中分离出来的罪名。所谓倒卖文物罪，是指以牟利为目的，倒卖国家禁止经营的文物，情节严重的行为。
非法经营罪与倒卖文物罪的区别主要表现在：
1、侵害的客体不同。非法经营罪侵犯的是全国人大及其常委会制定的法律，国务院制定的行政法规、规定的行政措施、发布的决定和命令所确立的市场准入制度；而倒卖文物罪侵犯的是国家对文物的正常管理活动。
2、犯罪对象不同。非法经营罪的犯罪对象主要是国家专营、专卖的物资，限制买卖的物品以及相关证件和公文、非法出版物、外汇等；而倒卖文物罪的犯罪对象是国家禁止自由买卖的文物。
3、行为表现不同。非法经营罪的行为方式多种多样，可以发生在经济领域包括生产、流通领域的收购、储存、运输、加工、批发、零售等各个环节中任何一个单一的环节都可以构成非法经营罪；而倒卖文物罪只有“倒卖”一种行为方式。“倒卖”行为不是单纯的买或者卖，而是一个整体，它包含对文物的非法收购、贩卖和转手倒卖等行为。因此，仅有收买或者出卖文物的行为，不能被认定为倒卖文物罪。
4、两罪的侧重点不同。非法经营罪强调的是主体有无经营权；而倒卖文物罪强调的是行为对象是否为国家禁止经营的文物。
对于文物来说，存在可以经营的文物，也存在国家禁止经营的文物。从主体上说，存在有文物经营权的单位和无经营权的个人和单位。把主体和对象结合起来，一共有四种可能性：一是有经营权的单位经营可以经营的文物；二是有经营权的单位经营国家禁止经营的文物；三是无经营权的单位和个人经营可以经营的文物；四是无经营权的单位和个人经营国家禁止经营的文物。不同的组合就可能存在罪与非罪的区别；不同的组合也可能存在此罪与彼罪的区分。下面，对这四种组合逐一进行分析：
（1）对于第一种情况来说，行为主体合法，行为对象也合法，因此，这种情况是完全合法的行为。
（2）第二种情况中，有经营权的单位是指有文物经营权的单位。对于国家禁止经营的文物，是不存在有无经营权的问题的，因为，只要是国家禁止经营的文物，即使是有经营权的单位亦无经营该文物的权利。在这种情况下，由于倒卖文物罪中的客观方面要求必须是倒卖文物，因此，如果只是单纯的出卖行为，如果其符合非法经营罪的构成要件，则应该定非法经营罪；如果是既卖出又买入文物，即倒卖文物，则构成倒卖文物罪。
（3）对于第三种情况，非常明显可以排除触犯倒卖文物罪的可能。因为，这种情况经营的对象属于非国家禁止经营的文物。但是，如果自然人或单位，没有文物的经营权，而将收藏的文物作为商业活动来经营，则可能构成非法经营罪。因为，根据2002年修订的《中华人民共和国文物保护法》（以下简称《文物保护法》）第五十条的规定，文物收藏单位以外的公民、法人和其他组织从合法渠道取得的文物可以依法流通。
但这里所说的“流通”是指以收藏为目的的流通。这从该法第五十五条的规定可印证，第五十五条规定，除经批准的文物商店、经营文物拍卖的拍卖企业外，其他单位或者个人不得从事文物的商业经营活动。所谓商业经营活动就是指以赢利为目的的商业行为。因此，如果无经营文物权利的单位和个人，以赢利为目的经营文物，便侵犯了《文物保护法》所规定的文物经营市场的准入制度，只要其行为达到情节严重的程度就可定性为非法经营罪。
（4）第四种情况与第二种情况并无实质上的差别，因为，只要是国家禁止经营的文物，任何单位和个人都无经营权，因此，对这种情况的处理与第二种情况是一样的，即如果倒卖国家禁止经营的文物，则构成倒卖文物罪；如果只是单一的出卖行为，则可能构成非法经营罪。
