一、与生产、销售伪劣商品罪的区别
前罪侵犯的是国家商标管理制度，实施假冒商标情节严重的行为；
后罪侵犯国家对商品质量的管理制度，实施在产品中掺杂使假、以假乱真、以次充好或者以不合格产品冒充合格产品的行为。
对于采用假冒注册商标的手段生产、销售伪劣商品，且销售数额特别巨大或者造成严重后果的，既触犯了生产、销售伪劣商品罪，也触犯了假冒商标罪。对于此种情况，应按照重罪吸收轻罪的原则，以刑罚较重的生产、销售伪劣商品罪定罪量刑。
二、与注册商标的区别
在判断假冒商标与注册商标是否“基本相同”方面，可否在理论上提出一个具体的标准呢？
由于注册商标的形式多种多样，假冒商标的形式也五花八门，所以理论中不好提出一个准确的标准。但是，存在一个基本的准则，那就是：以普通消费者的一般注意力作为评判的主观标准，采取整体比较与商标显著部分比较相结合的方法综合判断，如果普通消费者（不是专业人士或者该商品领域的行业人员）认为两个商标相比较，文字、图形或者文字与图形的结合没有区别或者视觉上没有差别，这两个商标就是“相同”商标；如果普通消费者认为两个商标相比较，文字的字形、读音、含义，或者图形的构图及颜色，或者文字与图形的整体结构是相似的，则属于近似商标。比如凤凰牌自行车商标中凤凰图案的尾巴上的羽毛是12根，如果行为人只是把羽毛的根数作成13根或11根，构图的颜色和尺寸结构等其他方面与注册商标又完全相同，则对普通消费者来说，这种羽毛根数的差别是难以区别的，假冒商标便是与注册商标“基本相同”的。
在判断假冒商标与注册商标是否相同时，司法实践中还出现这样一个问题：注册商标所有人自己在商品上使用的商标，与其核准注册的商标并不一致，那么，判断行为人假冒的商标是否与注册商标相同时，是将假冒的商标与核准注册的商标相比较，还是与注册商标所有人实际使用的商标相比较呢？比如，美国微软公司将MICROSOFT（大写）申请注册为其计算机软件商标，但微软公司在计算机软件上实际使用的商标Microsoft只有第一个字母是大写。如果被告人在假冒微软公司的计算机软件上也使用商标Microsoft，是否可以构成假冒注册商标罪？
司法实践中有这种现象，只不过有时没有被认为是一个问题。假冒注册商标罪惩治的是侵犯注册商标的专用权的行为，因此，从客体的角度理解，如果行为并没有侵犯到注册商标的专用权，是不能对其进行刑法评价的。注册商标所有人没有正确使用其注册商标，而被告人假冒其实际使用的、与注册商标不同的商标，情节再严重，也不能追究刑事责任，因为被告人并没有侵犯注册商标的专用权。
