1、证据的收集
证据是判定行为人是否构成犯罪以及构成何种犯罪的客观依据。由于非法集资犯罪往往作案周期长、受害人数多、涉案金额大，因此更需要重视对非法集资类犯罪各类证据的全面收集。既要重视对言词证据的收集，又要重视对虚假宣传材料、股权证、协议书等书证及电子数据的收集取证。对犯罪嫌疑人、被告人供述的提取，应紧紧围绕非法集资的非法性、公开性、利诱性、社会性四个特征进行，并将非法集资资金的管理、使用、用途作为重点进行取证，同时还应查明涉案款物的去向以及犯罪嫌疑人、被告人的退赔能力。
对被害人陈述的提取，应主要围绕参加集资的起因、方式、金额、回报（方式、次数、金额）、损失金额等方面进行；对被害人人数众多的案件，为全面查明被害人的实际损失，侦查机关还应及时发布公告要求被害人限期申报债权，对被害人进行确认，并及时告知相关权利及义务。
对涉案书证，应当调取包括非法集资方案、宣传手段，资金来源、资金管理、使用、流向等方面的书证，重点是所集资金的管理、使用、用途等影响非法集资行为定性方面的书证；对财务账目齐全，被告人及相关财务人员均能印证财务书证的案件，应以财务账目为核心进行取证；同时，由于司法审计报告是认定犯罪嫌疑人、被告人非法集资金额、损失数额、犯罪金额的主要证据，是重要的定罪量刑依据，因此对具有相应财务资料的，侦查机关在立案侦查后一般还应及时委托相关单位进行审计或者出具司法会计意见。
同时，在收集非法集资类犯罪案件的证据时，还要紧扣各类非法集资犯罪案件的构成要件，以便于区分此罪与彼罪，如在侦查过程中要充分注意收集犯罪嫌疑人、被告人是否具有非法占有目的的证据，以区分行为人是构成非法吸收公众存款罪或集资诈骗罪。对共同犯罪的，应当查明各行为人在共同犯罪中的作用和地位，对资金的分配、控制或挥霍的数额等，以便于判定行为人在共同犯罪中的作用与地位。
2、证据的认定
在非法集资犯罪相关证据材料的认定中，除了要注重证据的合法性和真实性外，更需要注重证据的关联性。《意见》第六条也规定，“办理非法集资刑事案件中，确因客观条件的限制无法逐一收集集资参与人的言词证据的，可结合已收集的集资参与人的言词证据和依法收集并查证属实的书面合同、银行账户交易记录、会计凭证及会计账簿、资金收付凭证、审计报告、互联网电子数据等证据，综合认定非法集资对象人数和吸收资金数额等犯罪事实。”
同时，在判定上要秉承“疑罪从轻”的办案理念，一切以事实为依据，以法律为准绳。例如非法吸收公众存款罪与集资诈骗罪的区分方面，需要判定行为人是否具有非法占有目的，非法占有目的属于主观故意范畴，而主观故意往往难以从某一个证据中剥离出来，因此，在认定时就需要结合相关物证、书证，证人证言以及被告人的供述和辩解作“排除法”。
