协议离婚后抚养费的计算方式为:1、有固定收入的,抚育费一般可按其月总收入的百分之二十至三十的比例给付;2、负担两个以上子女抚育费的,比例可适当提高,但一般不得超过月总收入的百分之五十;3、无固定收入的,抚育费的数额可依据当年总收入或同行业平均收入;4、有特殊情况的,如子女长期患有重大疾病、或子女残疾的,可适当增加。