工程合同问题（五）
更新时间：2011-11-30 11:07:23
问题描述：
甲公司（建设单位）与乙公司（施工单位）订立房屋建筑施工承包合同（总价包干+垫资），合同约定：竣工日期为2005年5月30日（工期为2年），每延误一日承担万分之三的工期违约金；合同履行过程中由于施工单位资金不足、质量返修（系施工方原因）等因素，导致工期严重拖期，双方于06年6月30日签订了一份补充协议，“鉴于乙公司在质量、工期等方面未能按约履行，且还提出不合理的要求，甲公司现要求乙公司对该工程施工务必于06年12月30日之前完工结束”；该工程于06年12月20日最终完工，后来甲公司于2007年6月30日向法院提起诉讼：要求乙公司支付工期违约金（自2005年5月30日开始计算至实际完工之日），问题由此产生；1、假如本案件中没有双方签订的补充协议，施工主以甲公司超过诉讼时效为由（因为合同约定了竣工日期，如果此时尚未竣工，甲公司就知道或应当知道自己的权利已被侵害，诉讼时效应当从此时开始计算，那么已经超过了2年），要求法院驳回甲公司的诉讼请求；此说法对吗？请说明理由；2、补充协议是否构成了对合同约定竣工日期的变更？请说明理由；3、甲公司在该合同中是实际上的受损方，那么在工程实务中，应如何在补充协议中进行约定，才不致于被乙公司或者法院理解为对合同约定工期的变更？
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