在离婚案件中，若夫妻一方主张分割双方名下在公司的股权，法院一般将夫妻双方均视为公司股东，不强调夫妻之间特定的身份关系。也就是说会按照股东关系来处理。
法院处理夫妻双方持股的通常方法，一般是适用调解解决，在双方对股权达成一致意见之后，通过出具调解书的形式，将股权的处理结果进行固定，并由当事人凭调解书办理相关变更登记手续。但是，在处理时，法院应审查公司章程有无另行规定，对于股东转让股权有无其它合法的限制条件(比如，公司章程设定了股东转让给其它股东的限制条件，而不只是拘泥于“优先购买权”。
但是，如果配偶双方在离婚案件中，对双方名下的股权分割不能达成一致意见，而公司又存在其它股东、即股东人数不限于夫妻二人的情况下，一般会建议当事人另案依《公司法》的规定处理股东间内部争议，或建议当事人另案提起离婚后财产纠纷。但是，法院可以在判决书中确认，虽然夫妻双方名下的股权持股比例不同，但仍均属夫妻共同财产(夫妻另有另行明确约定除外)。
对于虽然夫妻双方持股，但是一方冒名擅自转让双方名下股权的问题，实践中发现，一些法院(甚至最高法院)在处理这个问题时以“家事代理权”为由，结合《婚姻法》与《最高人民法院关于贯彻执行<民法通则> 若干问题的意见》第89条的规定，认定在股权转让协议上签字的配偶一方冒用“未知情”的配偶另一方(也为股东)的行为，系行使“家事代理权”，从而认定在配偶双方均持股的情况下，使得配偶单方转让双方名下的股权的行为归于有效。这是一个很严重的问题。因为现实中我们经常遇到这样的当事人，很多夫妻，一方在外从事经营活动，另一方并不一定了解。如果夫妻感情破裂，分割财产时，不清楚配偶经营情况的一方就很容易陷入被动。从事经营一方可以通过虚假借款、虚假债务、虚假财务报告、虚假股权转让、虚假股东等形式侵吞配偶利益。作为被损害方，往往由于不清楚不掌握情况而处于无证据的不利地位。因此，夫妻双方都应该在平时参与家庭财产管理事务，不要忽视自己的知情权，如果发现或察觉一方意图损害自己权益，那就尽量掌握财务相关资料和相应证据，尽快向专业婚姻律师求助。
