行使国家侦查、检察、审判、监狱管理职权的机关及其工作人员在行使职权时侵犯公民、法人或者其他组织的合法权益造成损害的，该机关为赔偿义务机关。
我国赔偿义务机关有以下几类：
(1)侦查机关。侦查机关是行使国家侦查权的国家机关，在办理案件过程中，依照法律进行专门的调查工作和采取必要的强制措施。根据《刑事诉讼法》的规定，有权进行侦查的机关和部门是：公安机关、人民检察院、国家安全机关、军队保卫部门和监狱。其中，人民检察院依照管辖的规定对部分案件行使桢查权;国家安全机关依照法律规定，办理危害国家安全的刑事案件，行使与公安机关相同的职权;军队保卫部门对军队内部发生的刑事案件行使侦查权;对罪犯在监狱内犯罪的案件由监狱进行侦查。
(2)检察机关。检察机关即人民检察院，人民检察院作为国家的法律监督机关，在刑事诉讼中行使检察权，具体有检察、批准逮捕、检察机关直接受理的案件的侦查、提起公诉。
(3)审判机关。人民法院作为国家的惟一的审判机关，代表国家通过审判民事案件(包括经济案件、知识产权案件)、刑事案件以及行政诉讼案件，行使司法审判权的职责。
(4)监狱管理机关。监狱管理机关是指对监狱实行管理，依法行使监督职权的国家司法行政机关。如司法部劳动改造管理局、省、自治区、直辖市司法厅(局)劳动改造管理局及所属的各级狱政管理部门。
《中华人民共和国国家赔偿法》第二十一条对此有专门规定：
行使侦查、检察、审判职权的机关以及看守所、监狱管理机关及其工作人员在行使职权时侵犯公民、法人和其他组织的合法权益造成损害的，该机关为赔偿义务机关。
对公民采取拘留措施，依照本法的规定应当给予国家赔偿的，作出拘留决定的机关为赔偿义务机关。对公民采取逮捕措施后决定撤销案件、不起诉或者判决宣告无罪的，作出逮捕决定的机关为赔偿义务机关。再审改判无罪的，作出原生效判决的人民法院为赔偿义务机关。
二审改判无罪，以及二审发回重审后作无罪处理的，作出一审有罪判决的人民法院为赔偿义务机关。
