抵消使双方债权按照抵消数额而消灭。之所以如此，是因为从自动债权方面看，不能超过自己的债权额获得满足;从受动债权方面看，也仅于获得满足的范围，即仅就自动债权额消灭其债权。由此决定，一方的债权额大于对方的债权额时，前者仅消灭一部分债权额，后者则全部消灭。
抵消使双方债权溯及到得为抵消时消灭。所谓得为抵消时，是指抵消权发生之时。如果双方债权的抵消权发生之时不同，则应以抵消人的抵消权发生时为标准。被抵消人嗣后纵为抵消的意思表示，也不得溯及其抵消权发生时产生抵消效力，因为其抵消权已依对方的抵消意思表示归于消灭。至于溯及力的内容，包括双方债权的担保及其他从权利，均从得为抵消时消灭;双方债权的利息债权，均从得为抵消时消灭;给付迟延、受领迟延、违约金、赔偿损失金等，均从得为抵消时消灭。
