依照《城市房屋拆迁管理条例》及《安徽省城市房屋拆迁管理办法》的规定，拆除产权有争议之房屋，在房屋拆迁主管部门公布的拆迁期限内，拆迁纠纷不能解决的，由拆迁人提出拆迁补偿和安置方案，报房屋拆迁主管部门批准后实施拆迁。房屋拆迁主管部门在批准拆迁人拆迁该房屋时，应当组织拆迁人对被拆除房屋进行勘察并作记录，并申请公证机关办理证据保全公证。
可见，对产权有争议的房屋的拆迁补偿应有两种结果：一是争议在拆迁主管部门公布规定的拆迁期限内已解决的，应按照各方当事人的房屋产权份额进行拆迁补偿;二是争议在拆迁主管部门公布规定的拆迁期限内未解决的，因城市建设的需要和拆迁的时效原因等，拆迁人不可能等到产权纠纷的解决，则依法由拆迁人提出拆迁补偿和安置方案，报拆迁主管部门批准后实施拆迁，在实施拆迁的过程中，应当对被拆除的房屋作勘察并作好记录，并应当办理证据保全公证手续。
实践中，拆迁中的产权争议一般有以下情况：
1.原房屋产权人死亡后，继承人未办理继承及析产手续的房屋，在拆迁开始时继承人要求继承和析产的;
2.联合建设的房屋，虽经有关部门批准建设，但联合建设的当事人未能就联合建设的房屋的产权进行约定，或者虽有约定但双方当事人仍然有争议的;
3.一方当事人虽然已经取得房屋产权证书，但他方当事人已经明确提出产权主张(这种产权主张一般情况下应当是向法院提起民事或者行政诉讼，明确提出产权的诉讼请求);
4.已经建成的房屋未取得产权证书，当事人各方主张房屋产权的;
5.因房屋产权转让的过程中出现若干问题，造成产权发生争议的;
6.因历史上落实私房政策问题导致的产权争议;
7.其他产权争议的情形。
如果产权有争议的房屋已经发生拆迁，但一方当事人对拆迁结果不服，也可以通过以下方式维护权益：
1.拆迁人已经与一方当事人签订拆迁协议的，主张产权的一方当事人可以直接请求人民法院判决宣告拆迁协议无效;
2.房屋产权主管部门在产权争议的解决期间已经作出拆迁裁决，将拆迁补偿款裁决给一方当事人的，另一方当事人可以向人民法院提起拆迁裁决的行政诉讼，请求人民法院判决撤销该裁决;
3.如果房屋产权主管部门批准的拆迁人关于拆除产权有争议之房屋的拆迁方案侵害当事人的合法权益的，任何一方当事人均可以请求人民法院判决撤销房屋拆迁主管部门批准的拆迁补偿方案，并可以请求人民法院判决房屋拆迁主管部门重新作出具体行政行为;
4.如果拆迁主管部门未能依照法律规定组织拆迁人勘察被拆除房屋，未进行证据保全公证的，任何一方当事人均可以请求人民法院以房屋拆迁主管部门违反法定程序为由判决撤销拆迁主管部门作出的批准拆迁产权有争议房屋的行政行为。
