主合同是不以他种合同的存在为前提，不受其制约而能独立存在的合同。既然有主合同，那么相对应的就应该存在补充合同，那么主合同和补充合同有什么区别呢？
一、主合同与补充合同
合同是平等主体的自然人、法人、其他组织之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议。本来在合同法中并没有“主合同”和“补充合同”的专用术语，但因为在现实合同管理实践过程中，经常会出现这种补充合同的现象，为了区别于补充合同的称呼，所以，我们将双方在第一时间内签订的合同称之为主合同，而在其后双方以主合同为基础，另外协商而达成的协议称之为补充合同。
所谓主合同，是指甲乙双方经过反复磋商冾谈，在第一时间内就某一标的交易或服务标的达成的协议。
所谓补充合同，是因为签订主合同时某些约定一时无法展开，或者因主合同的粗线条性未及说明，或者因主合同某些约定有遗漏等等，双方在主合同基础上另外协商而达成的协议。
但当主合同的履约条件、因素发生了相对不大地改变，而导致双方履约出现障碍，双方经磋商认为主合同有继续履行的必要时，在主合同基础上对某些约定进行 “适当”地补充或修改而成立的协议，也可以称其为补充合同。此处所述“适当”一词，从定量的角度来看，一般不会超过三个以上，如果超过三个以上，那就得另当别论了。
二、补充合同的作用
补充合同要表达的内容和作用，一般来说，一是对主合同履行操作上的约定，具有可操作的实质意义。二是对主合同中某些条款的意思解释、说明和展开，具有备忘和统一认识的意义。三是对主合同在签订时遗漏的项目进行补充的新约定，具有拾遗补漏完善合同的意义。四是对主合同某些条款进行强调，具有增强双方共同遵守合同约定不可违约的意义。主合同与补充合同前后衔接一脉相承，补充合同对主合同具有“强身健体”，使主合同更完善的作用。补充合同不能破坏主合同的基本要件或主要条款的约定，否则，补充合同也就不能成其为补充合同了。
三、主合同与补充合同的关系
主合同与补充合同一般不会同时产生，应该会有时间差，主合同成立时间在前，补充合同成立时间在后，这是补充合同产生的时间规律。所以，补充合同是主合同的从属合同，补充合同依附于主合同而成立，没有主合同，就不会产生补充合同，这是主合同与补充合同基本关系。当然，主合同因为有了补充合同，所以使得主合同原意更准确、更完善、更具有可操作性。正因为如此，补充合同的编号往往是以主合同为依托而表达的，如××××号合同补1、补2……，这是强调二者主从关系的实质体现。在日常合同管理过程中，正因为有了补充合同这种特殊形式，所以能够保证双方履约顺利，合同纠纷减少。
当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行，因为时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质，如果仍以主合同的原条款为准执行，那么就失去了补充合同存在的意义。
四、补充合同与合同变更
如果补充合同对主合同“补充”太多的新约定，那么该补充合同就难以称之为补充合同了。另外补充合同对主合同修改得太多，超过了前述“适当”的量，或者补充合同对主合同的实质要件进行了较大的“补充”修改，如对价格条款，技术标准，履约期限等约定进行了不利于其中一方的修改，这也不能称之为补充合同，这些“补充”和修改已经符合合同变更的要求，应该称之为合同变更。当然，变更合同也是补充合同的一种形式，但它的实质不是补充合同，而只是以“补充合同”的表象出现而已，即可以以补充合同的形式，表达对主合同或原合同进行修改的意思。因为变更合同也是以主合同或原合同的共识为基础，如果没有主合同或原合同的一些基本共识，当然不会出现合同变更之实。
五、第一时间内要对主合同进行“补充”的方法
如果有的约定因为具有特殊性，在主合同中不便表达，或者有的约定内容过多，在主合同中难以表达，而这些内容又必须在第一时间与主合同一起签订时，那么可以在主合同中对此项内容采取“略述”或“点到”的方式进行约定，然后以括号的形式注明“(详细内容见附件)”。附件的名称可以有名，也可以无名。有名附件可以称谓“会谈纪要”、或“谈判纪要”、或“备忘录”。无名附件直接称为附件一、附件二……，在无名附件的情况下，尽可能地给附件赋予一个能表达中心内容的名称。以附件形式对主合同进行“补充”时，应该强调附件是主合同的构成部份，与主合同具有同等法律效力，同时附件也要经双方签约代表签字，加盖合同专用章，然后与主合同一起加盖骑缝章，以便保证附件的有效性和增强防伪功能。
主合同是纲，补充合同是目，纲举目张，只有主合同成立有效，补充合同才能成立有效。补充合同的性质是主合同的从属合同，补充合同不可能与主合同一同产生，既然补充合同是主合同的从属合同，那么补充合同就只能在“补充”二字的意义上发挥作用。
